Análisis de las Polihidroxialcanoato Sintasas (PhaC1 y PhaC2) en una Cepa de Pseudomonas Fluorescens IBUN S1602, Aislada en Suelos Colombianos / Serrano Riaño, Julieth; Sastoque Rivera, Luz Ángela; Montoya Castaño, Dolly; Moreno Sarmiento, Nubia
Material type: ArticleLanguage: English Description: : ilISSN: 0120 6052Subject(s): CEPA-AISLAMIENTO CAÑA DE AZUCAR -- PUBLICACIONES SERIADAS | CEPA-GRUPO DE AISLAMIENTO -- PUBLICACIONES SERIADAS | BIOINFORMATICA -- PUBLICACIONES SERIADAS | BIOPOLIMERO -- PUBLICACIONES SERIADAS | PHAC1 -- PUBLICACIONES SERIADAS | PHAC2 -- PUBLICACIONES SERIADAS In: Revista Colombiana de Biotecnología No.2, vol.13 (2011). p-- 84 - 96Summary: La cepa Pseudomonas fluorescens IBUN S1602 conforma el grupo de aislamientos provenientes de suelos colombianos de caña de azúcar, que acumula polihidrioxialcanoato (PHA), fue seleccionada como promisoria para escalamiento comercial por tener afinidad por sustratos alternativos y económicos como el glicerol, aceites usados, suero de leche, entre otros. Dada la importancia de la enzima sintasa en la síntesis de los PHAs, en el presente trabajo se realizó el análisis molecular de los genes phaC1 y phaC2 que codifican las enzimas sintasas tipo II (PhaC1 y PhaC2). Para la obtención de los amplímeros requeridos en la secuenciación, se utilizó la técnica de PCR bajo condiciones estandarizadas para iniciadores diseñados reportados en las bases de datos. Se identificaron dos fragmentos de 1680 pb y 1683 pb correspondientes a phaC1 y phaC2. El análisis comparativo de las secuencias proteicas resultantes de estos genes demuestra que la sintasa IBUN S1602 contiene la región a/ß hidrolasa y 8 residuos de aminoácidos conservados, que son características de las sintasas examinadas a nivel mundial. Se analizó la estructura enzimática a nivel primario y se predijo la secundariaLa cepa Pseudomonas fluorescens IBUN S1602 conforma el grupo de aislamientos provenientes de suelos colombianos de caña de azúcar, que acumula polihidrioxialcanoato (PHA), fue seleccionada como promisoria para escalamiento comercial por tener afinidad por sustratos alternativos y económicos como el glicerol, aceites usados, suero de leche, entre otros. Dada la importancia de la enzima sintasa en la síntesis de los PHAs, en el presente trabajo se realizó el análisis molecular de los genes phaC1 y phaC2 que codifican las enzimas sintasas tipo II (PhaC1 y PhaC2). Para la obtención de los amplímeros requeridos en la secuenciación, se utilizó la técnica de PCR bajo condiciones estandarizadas para iniciadores diseñados reportados en las bases de datos. Se identificaron dos fragmentos de 1680 pb y 1683 pb correspondientes a phaC1 y phaC2. El análisis comparativo de las secuencias proteicas resultantes de estos genes demuestra que la sintasa IBUN S1602 contiene la región a/ß hidrolasa y 8 residuos de aminoácidos conservados, que son características de las sintasas examinadas a nivel mundial. Se analizó la estructura enzimática a nivel primario y se predijo la secundaria
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